я последний раз заполнял протокол об АПН года 1.5-2 назад. я не знаю, может сейчас бланки поменялись, но все те, что заполнял я, имели несколько строк для свидетелей, и 2 или 3 строчки для объяснений.

в любом случае, даже если объяснение пишется на отдельном листе, вам же дают сам протокол на подпись, а значит можно вписать и свидетелей.
кроме того, что мешает вписать свидетелей на листе объяснений? или написать там, что гаец отказывается вписывать ваших свидетелей?