Я бы успокоился

ПЦР - весьма точный прямой метод, показывающий наличие самого возбудителя. В отличии от косвенных, типа реакции Вассермана, которая показывает наличие в крови антител.
Минусом метода как раз считается достаточно высокий процент ложно-положительных реакций.