Тоже использую наладон правда виндовый. Сам долго думал как составлять такой список с как можно меньшим гимором. Меня то уже ломает куда либо и что либо копировать. На компе поступаю следующим образом использую Local Website Archive для сохранения страничек в первозданном виде там и иерархию можно организовать и заметки добавить (туда и пишу подробности). Дальше конечно идеально бы было иметь такого же клиента на покете и синхронизировать оба девайса на уровне файлов но увы такового не нашел. Далее периодически выгружаю все из этой программы в HTML и записываю на флешку которую и рассматриваю на покете. при этом все оригинальные ссылки остаются можно и в кафе по вайфаю проверить актуальность или по жопорезу. Из минусовсамой программы нет возможности запоролить ветку дерева а хотелось бы.